LOADING

往者已矣 来者可追

很高兴在互联网的辽阔疆域中遇见你。

2025-12-25 BI
@wslll

开源分享:经过运行验证的自动SNP Calling脚本

为应对非标准化集群算力调用难题,作者开发了Auto-Fish-SNP-Calling自动化变异检测流程。该流程包含环境部署和核心分析两个脚本,支持单样本与批量处理,覆盖从FASTQ到高质量VCF的完整GATK Best Practices步骤,已在千级鱼类基因组上验证。
阅读全文
2025-12-18 BI
@wslll

使用glnexus进行joint call的一些经验

作者分享使用glnexus进行大规模群体变异检测的经验。建议直接使用默认方式而非染色体拆分并行,后者会大幅增加时间和存储消耗。推荐通过Docker镜像调用软件以简化部署,并需准备充足内存(如2.4TB GVCFs约需1TB RAM)。文末附有不同物种的运行数据参考。
阅读全文
2025-12-01 Code
@wslll

wslll blog:基于Python的自托管博客应用

基于Flask的双语博客系统,集成DeepSeek AI实现翻译、摘要和对话功能,支持Markdown写作、照片墙和短信验证码登录。项目采用简约设计,适合注重内容创作的开发者使用Docker部署。
阅读全文
2025-11-30 Others
@wslll

wslll blog的介绍以及2025年不稳定运行的原因

wslll博客自2022年9月建立,经历了从Typecho到Halo、Ghost的框架变迁。2025年4月因服务器误删导致数据丢失,促使站主重新思考博客定位。2025年11月起,基于Python自主开发了简洁、支持AI与双语功能的wslll-blog应用,并计划未来完善部署与serverless方案。
阅读全文
2024-12-16 BI
@wslll

使用SimpleM计算有效检验数量

SimpleM是一种用于GWAS多重检验校正的统计方法,通过分析SNPs间的连锁不平衡,计算有效检验数量(Meff),以更合理地调整显著性阈值,避免传统方法因过度严格而遗漏真实信号。
阅读全文